Cerkev sv. Jerneja poznamo bolj pod imenom Stara cerkev. Mala romanska cerkev stoji pod Šišenskim hribom, stisnjena med visoke stanovanjske bloke, ob Celovški cesti in nedaleč od parka Tivoli .
Cerkev je prvič omenjena že leta 1370. Pred njo je bil namreč 30. oktobra 1370. leta sklenjen mir med Habsburžani in Beneško republiko. Prostor na katerem stoji pa je bila takrat vas Spodnja Šiška, ki je bila prvič omenjena že 1308. leta.
Veliko kasneje so pred cerkvijo prirejali žegnanja na Jernejevo ali Komarjevo nedeljo, to je prva nedelja v avgustu. Ob tem so priredili pravo veselico in parado, na stojnicah pa so prodajali lect, lončevino in suho robo.
Leta 1933. pa so po načrtih arhitekta Jožeta Plečnika cerkev obnovili, ker je bila zaradi vlage močno uničena. Kmalu zatem pa so dodali ob cerkvi še stopnišče, ki vodi do Cekinovega gradu in naprej v Tivoli.